99年政府補助全民健保保險費1,226億元，較98年增加10.5％，主因99年4月起健保費率由4.55％調為5.17％，政府按比例之負擔金額增加，以及配合實施差額補助所致；另為保障弱勢人口就醫權益，政府亦補助老人、身心障礙者、弱勢兒童及少年、失業勞工、原住民等應自付之健保費，其中以補助高齡者41億元最多，身心障礙者38億元居次，而對中低收入兒童及少年、育嬰留職停薪者雇主之健保費補助，隨相關政策開辦第2年申辦民眾漸多而倍增，另失業勞工健保費補助則隨失業人數回降，減幅近5成。(資料來源：主計處2/14)
